Le fléau maléfique de Nobunaga s'est maintenant propagé à travers le temps pour affecter l'avenir. Alors que Samanosuke se prépare au combat, un nouveau héros entre en scène : Jacques Blanc, officier militaire français.

Deux héros originaires de pays et d'époques différents doivent voyager à travers le temps et l'espace pour vaincre le maléfique Nobunaga et ses hordes des ténèbres.

Contrôlez le destin de ces deux hommes en voyageant du Japon du XVIe siècle à Paris moderne et vice-versa. Onimusha 3: Demon Siege est le dernier chapitre de la trilogie Onimusha.